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中國農業科學院深圳農業基因組研究所（以下簡稱“基因組所”）是中國農業科學院和深圳市共同舉辦的新型國家級研究所，創辦于2014年1月。基因組所入選科技部、中組部等七部委遴選的科技體制改革試點單位。經過7年的發展，基因組所已經初步建立了以組學技術為核心的學科體系，組建組學技術、合成生物學、植物基因組、動物基因組、生態基因組5個研究中心，正在籌建食品科學研究中心；匯聚了包含20余名國家級人才在內的600余人的研究隊伍；和海內外大學共同建設中國農業科學院深圳研究生院，培養農業和食品領域的高層次人才；擁有“嶺南現代農業科學與技術廣東省實驗室深圳分中心”“農業農村部基因數據分析重點實驗室”和中國農業科學院深圳綜合試驗基地；在Science、Nature、Cell等頂級雜志上發表SCI論文近300余篇，申請專利100余項，授權專利30項，舉辦國際農業基因組學大會，奠定了我國農業基因組學的國際地位；2019年、2020年連續兩年自然指數排名全國農業類科研院所第一名，多項成果入選“‘十三五’農業科技十大標志性成果”“中國生命科學十大進展”“中國農業科學十大進展”。先后獲得“何梁何利基金”獎、“周光召基礎科學獎”“深圳經濟特區建立40周年創新創業和先進模范人物”“深圳市市長獎”等獎勵。